MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 2069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	TCT	2	6	19	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003267	TTAG	2	8	85	92	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003267	AGTTA	2	10	123	132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003267	A	7	7	154	160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003267	TGA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003267	AGTA	2	8	385	392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003267	TCA	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003267	T	6	6	421	426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003267	AGAT	2	8	432	439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003267	TAT	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003267	AAT	3	9	557	565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227375
12	NC_003267	TGG	2	6	587	592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227375
13	NC_003267	TGT	2	6	615	620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227375
14	NC_003267	CAGT	2	8	634	641	25 %	25 %	25 %	25 %	17227375
15	NC_003267	T	7	7	676	682	0 %	100 %	0 %	0 %	17227375
16	NC_003267	CGG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227375
17	NC_003267	GTG	2	6	719	724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227375
18	NC_003267	GTGG	2	8	760	767	0 %	25 %	75 %	0 %	17227375
19	NC_003267	GAT	2	6	784	789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227375
20	NC_003267	CGG	2	6	821	826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227375
21	NC_003267	GGA	2	6	889	894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227375
22	NC_003267	GAC	2	6	982	987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227375
23	NC_003267	CTG	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227375
24	NC_003267	GCTT	2	8	1020	1027	0 %	50 %	25 %	25 %	17227375
25	NC_003267	TGCGC	2	10	1036	1045	0 %	20 %	40 %	40 %	17227375
26	NC_003267	G	6	6	1047	1052	0 %	0 %	100 %	0 %	17227375
27	NC_003267	GATT	2	8	1141	1148	25 %	50 %	25 %	0 %	17227375
28	NC_003267	TTGG	2	8	1180	1187	0 %	50 %	50 %	0 %	17227375
29	NC_003267	GTT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227375
30	NC_003267	A	6	6	1301	1306	100 %	0 %	0 %	0 %	17227375
31	NC_003267	CACCG	2	10	1329	1338	20 %	0 %	20 %	60 %	17227375
32	NC_003267	CGG	2	6	1359	1364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227375
33	NC_003267	TGA	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227375
34	NC_003267	CAG	2	6	1454	1459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227375
35	NC_003267	AGT	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227375
36	NC_003267	GT	3	6	1479	1484	0 %	50 %	50 %	0 %	17227375
37	NC_003267	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003267	TA	3	6	1570	1575	50 %	50 %	0 %	0 %	17227376
39	NC_003267	GCT	3	9	1738	1746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227376
40	NC_003267	CAA	2	6	1775	1780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227376
41	NC_003267	TCA	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227376
42	NC_003267	CTG	3	9	1943	1951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227376
43	NC_003267	GTGTTG	2	12	2008	2019	0 %	50 %	50 %	0 %	17227376
44	NC_003267	T	7	7	2025	2031	0 %	100 %	0 %	0 %	17227376
45	NC_003267	AGTTG	2	10	2108	2117	20 %	40 %	40 %	0 %	17227376
46	NC_003267	TTG	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227376
47	NC_003267	ATTA	2	8	2256	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	17227376
48	NC_003267	GTT	2	6	2309	2314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227376
49	NC_003267	TAG	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227376
50	NC_003267	ATC	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227376
51	NC_003267	TAA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227377
52	NC_003267	AATC	2	8	2609	2616	50 %	25 %	0 %	25 %	17227377
53	NC_003267	AGA	2	6	2630	2635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227377
54	NC_003267	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227377
55	NC_003267	GCT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227377
56	NC_003267	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	17227377
57	NC_003267	CTGT	2	8	2822	2829	0 %	50 %	25 %	25 %	17227377
58	NC_003267	TTTA	2	8	2845	2852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003267	CT	3	6	2931	2936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_003267	ACC	2	6	3015	3020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227378
61	NC_003267	ATA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227378
62	NC_003267	ATT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003267	ATC	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003267	TGC	3	9	3387	3395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_003267	TAG	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003267	ACC	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_003267	TAAA	2	8	3549	3556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003267	ACA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003267	GCA	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227379
70	NC_003267	CCA	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227379
71	NC_003267	ATG	2	6	3740	3745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227379
72	NC_003267	CT	3	6	3767	3772	0 %	50 %	0 %	50 %	17227379
73	NC_003267	CAG	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227379
74	NC_003267	GAA	2	6	3835	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227379
75	NC_003267	TTG	2	6	4052	4057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227379
76	NC_003267	CTA	2	6	4071	4076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227379
77	NC_003267	TGC	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227379
78	NC_003267	TAT	2	6	4189	4194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227379
79	NC_003267	TGA	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227379
80	NC_003267	CAAAA	2	10	4261	4270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003267	TCA	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227380
82	NC_003267	CGG	2	6	4319	4324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227380
83	NC_003267	ACC	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227380
84	NC_003267	A	6	6	4374	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	17227380
85	NC_003267	GCT	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227380
86	NC_003267	TTG	2	6	4462	4467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227380
87	NC_003267	GAA	2	6	4485	4490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227380
88	NC_003267	TCA	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227380
89	NC_003267	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227380
90	NC_003267	CTAG	2	8	4572	4579	25 %	25 %	25 %	25 %	17227380
91	NC_003267	CAAG	2	8	4604	4611	50 %	0 %	25 %	25 %	17227380
92	NC_003267	CAAT	2	8	4628	4635	50 %	25 %	0 %	25 %	17227380
93	NC_003267	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227380
94	NC_003267	AC	3	6	4728	4733	50 %	0 %	0 %	50 %	17227380
95	NC_003267	TGC	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227380
96	NC_003267	CAG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227380
97	NC_003267	GTC	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227380
98	NC_003267	A	6	6	5045	5050	100 %	0 %	0 %	0 %	17227381
99	NC_003267	GCG	2	6	5073	5078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227381
100	NC_003267	TTA	2	6	5087	5092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227381
101	NC_003267	TAC	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227381
102	NC_003267	AAC	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227381
103	NC_003267	A	6	6	5181	5186	100 %	0 %	0 %	0 %	17227381
104	NC_003267	GTCC	2	8	5240	5247	0 %	25 %	25 %	50 %	17227381
105	NC_003267	AATT	2	8	5268	5275	50 %	50 %	0 %	0 %	17227381
106	NC_003267	ACTG	2	8	5344	5351	25 %	25 %	25 %	25 %	17227381
107	NC_003267	AGA	2	6	5413	5418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227381
108	NC_003267	A	7	7	5506	5512	100 %	0 %	0 %	0 %	17227381
109	NC_003267	TGGC	2	8	5571	5578	0 %	25 %	50 %	25 %	17227381
110	NC_003267	CT	3	6	5627	5632	0 %	50 %	0 %	50 %	17227381
111	NC_003267	CAG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227381
112	NC_003267	TCT	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227381
113	NC_003267	CAG	3	9	5817	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227381
114	NC_003267	ACA	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227381
115	NC_003267	A	6	6	5906	5911	100 %	0 %	0 %	0 %	17227381
116	NC_003267	AAG	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227381
117	NC_003267	GCT	2	6	5950	5955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227381
118	NC_003267	CGA	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227381
119	NC_003267	ATT	2	6	5983	5988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227381
120	NC_003267	AAT	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227382
121	NC_003267	A	6	6	6068	6073	100 %	0 %	0 %	0 %	17227382
122	NC_003267	TGGC	2	8	6132	6139	0 %	25 %	50 %	25 %	17227382
123	NC_003267	GCC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227382
124	NC_003267	CT	3	6	6188	6193	0 %	50 %	0 %	50 %	17227382
125	NC_003267	CAG	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227382
126	NC_003267	TGC	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227382
127	NC_003267	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003267	A	6	6	6499	6504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003267	TCC	2	6	6515	6520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227383
130	NC_003267	TC	3	6	6537	6542	0 %	50 %	0 %	50 %	17227383
131	NC_003267	TCC	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227383
132	NC_003267	CTT	2	6	6667	6672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227384
133	NC_003267	CGACT	2	10	6689	6698	20 %	20 %	20 %	40 %	17227384
134	NC_003267	GGA	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227384
135	NC_003267	TG	3	6	6757	6762	0 %	50 %	50 %	0 %	17227384
136	NC_003267	ACT	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227384
137	NC_003267	TACT	2	8	7122	7129	25 %	50 %	0 %	25 %	17227384
138	NC_003267	TGT	2	6	7170	7175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227384
139	NC_003267	CTT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227384
140	NC_003267	GA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	50 %	0 %	17227384
141	NC_003267	GTA	2	6	7372	7377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227384
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143	NC_003267	ACG	2	6	7498	7503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227384
144	NC_003267	ACT	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227384
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147	NC_003267	GTTTT	2	10	7592	7601	0 %	80 %	20 %	0 %	17227384
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154	NC_003267	AGT	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_003267	CAA	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_003267	AATC	2	8	8152	8159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_003267	GAC	2	6	13580	13585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227390
275	NC_003267	GC	3	6	13767	13772	0 %	0 %	50 %	50 %	17227390
276	NC_003267	TCA	2	6	13831	13836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227390
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278	NC_003267	GAA	2	6	13931	13936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227390
279	NC_003267	CCCA	2	8	14009	14016	25 %	0 %	0 %	75 %	17227390
280	NC_003267	GGT	2	6	14045	14050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227390
281	NC_003267	AG	3	6	14071	14076	50 %	0 %	50 %	0 %	17227390
282	NC_003267	GCAA	2	8	14293	14300	50 %	0 %	25 %	25 %	17227390
283	NC_003267	TA	3	6	14334	14339	50 %	50 %	0 %	0 %	17227390
284	NC_003267	CGT	2	6	14369	14374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227390
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287	NC_003267	A	6	6	14575	14580	100 %	0 %	0 %	0 %	17227390
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291	NC_003267	TTG	2	6	14828	14833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227390
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295	NC_003267	TTC	2	6	15207	15212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227391
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299	NC_003267	ATT	2	6	15440	15445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_003267	T	6	6	15576	15581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_003267	AAT	2	6	15715	15720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_003267	ATA	2	6	15741	15746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_003267	AAC	2	6	20276	20281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227394
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403	NC_003267	ATTCA	2	10	20348	20357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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408	NC_003267	TGA	2	6	20608	20613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_003267	GTA	2	6	20637	20642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_003267	T	6	6	20706	20711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_003267	T	6	6	22558	22563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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